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新算法可识别与疾病相关基因


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新算法可以识别与疾病相关的基因。科技日报,北京,12月1日。

记者冯卫东。来自俄罗斯圣光机大学 ITMO 生物信息学的研究人员开发了一种算法,可以帮助评估基因对人类过程(包括疾病发展)的影响。该研究发表在 BMC 生物信息学上。

脱发、肥胖或视力不佳可能与特定基因有关。识别相关基因组有利于研究和治疗。此外,为了确定基因与疾病之间是否存在联系,了解基因之间的相互作用也非常重要。

ITMO 助理教授 Eriksie Sergei Sichev 解释说:“一般来说,每个人都有超过 20,000 个基因。通过将与患者病情相关的基因与健康人的基因进行比较,我们可以看出两者在活性和表现上的差异。根据这些信息,一个通用的图表可以是cr。ted 显示所有基因之间的相互联系,并且每个基因都被分配了一个加权因子。

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通常情况下,科学家只是继续研究 最活跃的基因被绘制在一个特殊的子图上,但这些是。因为它脱离了“共同背景”,失去了评估每个基因与其他基因之间关系以进行诊断的机会。

“在新的研究中,研究人员不仅专注于权重因子最高的基因系统,还提出了一种新方法,可以利用整个基因组的数据生成数十万个子图。该算法基于马尔可夫链蒙特Carlo. 罗罗方法可以计算出每个样本与所讨论条件之间的连接概率,并根据每个基因之间的相互作用来分析样本的组成。研究人员从一组基因中删除一个基因,如果活跃的数量基因增加,表示正确并保存结果。

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否则,重新开始。通过。

一系列步骤,权重因子开始快速增长。这样,算法就可以生成大量的图。有了这样的样本组,研究人员可以发现它比其他人更好。出现频率更高的基因。

如果一个基因出现在 90% 的此类子图中,那么该基因与相关疾病的关系就可以确定为 90%。该项目的研究人员指出,该算法将在未来出现。� 表示为带有滑块的程序,允许用户为各种目的生成具有各种置信度的结果。

例如,置信度越低,显示的基因越多,反之亦然。如果只需要确定可信基因,则可以将置信度设置为 99% 左右。编辑:张奥林。


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